Text
Molecular Docking Kombinasi Senyawa Thymol, Thymoquinone danp-Cymene terhadap Enzim Protease HIV-1 sebagai Anti HIV
Berdasarkan hasil validasi PDB didapatkan nilai RMSD sebesar 1,9679 Å
(PDB 3NU4), 1,9679 Å (PDB 3SO9), dan 1,4495 Å (PDB 6OPS). Skor docking kode PDB 3NU4 yaitu ligan native (-115,0210), S3 (-62,3845), S2 (-61,3111), S1(-57,3761), S3_S2_S1 (-62,3867), darunavir (-115,7850) dan quercetin (-115,7850). Kode PDB 3SO9 ligan native (-117,8630), S3 (-60,4552), S2 (-57,9926), S1 (-55,8365), S3_S2_S1 (-60,4584), darunavir (-115,5040), dan quercetin (-73,1602). Skor docking kode PDB 6OPS ligan native (-113,0500), S3 (-59,6056), S2 (-58,2316), S1 (-55,6827), S3_S2_S1 (-59,5235), darunavir (-110,1030), dan quercetin (-70,9403). Hasil tersebut kurang stabil jika dibandingkan dengan pembanding darunavir dan quercetin, sehingga senyawa tersebut kurang mampu berinteraksi dengan reseptor protease HIV-1.
Tidak tersedia versi lain