Text
Desain Turunan Benzylidine Sebagai Senyawa Antidiabetes Berdasarkan Hubungan Kuantitatif Struktur Aktivitas dan Penambatan Molekuler Terhadap α-amylase
Studi HKSA (hubungan kuantitatif struktur aktivitas) dan penambatan
molekuler bertujuan untuk mengembangkan senyawa obat yang lebih efektif dari
pada obat sebelumnya. Berdasarkan data IDF (International Diabetes Federation)
penderita diabetes melitus terus meningkat dari tahun ke tahun. Senyawa turunan
benzylidine diketahui memiliki efek antidiabet es dan dapat berperan sebagai
inhibitor enzim α-amylase. Tujuan penelitian ini untuk mendesain turunan senyawa
benzylidine berdasarkan HKSA dan penambatan molekuler terhadap α-amylase.
Metode HKSA menggunakan software Hyperchem untuk memodelkan dan
mengoptimasi geometri senyawa turunan benzylidine, dilanjutkan perhitungan
deskriptor, dan kemudian melakukan analisis statistik regresi multilinear
menggunakan build QSAR. Nilai r
2
mendekati 1 adalah nilai persamaan HKSA
yang dipilih. Persamaa HKSA digunakan untuk menghitung nilai IC50 prediksi
senyawa usulan. Penambatan molekuler terhadap α-amylase senyawa usulan
menggunakan software PLANTS dan YASARA. Hasil validasi metode doking
yang valid diperoleh dengan nilai RMSD kurang dari 2 Å. Skor doking senyawa
usulan dibandingkan dengan senyawa pembanding (acarbose). Visualisasi skor
doking dilakukan dengan Software Discovery Studio.
Analisis HKSA menghasilkan persamaan HKSA yaitu (-2,7499 x
qC3)+(1,457 x qC4)-(1,9574 x qC5)-(0,5565 x qO3)-(0,0321 x Vol)-(0,1768 x MR)
persamaan ini digunakan untuk mendesain 5 senyawa usulan turunan benzylidine
yang memiliki nilai IC50 2,45-4,17 nM. 5 senyawa tersebut dilakukan molecular
doking terhadap enzim α-amylase dengan kode PDB 1VAH. Validasi kode PDB
diperoleh nilai RMSD sebesar 0,4003 Å .Skor docking terbaik dari senyawa usulan
yaitu senyawa Br dengan nilai score docking -71,0252 dan nilai PIC50 5,801 yang
merupakan senyawa usulan terbaik sebagai antidiabetes berdasarkan HKSA dan
molecular docking.
Kata Kunci : α-amylase, Penambatan Molekuler, HKSA, Benzylidine, Diabetes
Millitus
Tidak tersedia versi lain